“长门！”
不远处，长门的父母看着这揪心的一幕，心痛万分却又无能为力。
而长门本人已经因为承受不住生扣双眼带来的剧烈疼痛，半跪在了地面上，自此失去了光明。
两颗带着鲜血的淡紫色眼球，正静静地躺在长门的手掌中。
“给、眼睛给你，放了我的父母……”
长门一边忍受着剧痛，一边伸出左手，将两颗轮回眼呈上。
“你还真的是……果决啊。”
就连一向心狠手辣的志村团藏，也自问做不到像长门这样，活生生地将自己的双眼挖出。这不仅仅需要莫大的勇气，更是要抱着必死的决心。
这些都是团藏不具备的，成为火影是团藏的执念，所以他更加怕死。
志村团藏与猿飞日斩、宇智波镜、秋道取风、水户门炎、转寝小春同为木叶隐忍者学校的同期学员，由第二代火影千手扉间直接领导。晋升上忍后他们六人加入第二代火影扉间的精锐护卫部队，成为队友。平时执行任务时志村团藏与猿飞日斩一组一起行动。他跟日斩有着很深的羁绊，两人视彼此为竞争对手而一直相互竞争着。
在第一次忍界大战中，金角银角在雷影与火影的结盟仪式上突然掀起政变，二人以六道忍具和九尾查克拉的力量，让第二代雷影和第二代火影受到了濒临死亡的重伤，随后，身负重伤的千手扉间带领部下猿飞日斩、水户门炎、转寝小春、志村团藏、秋道取风、宇智波镜突出重围，金角银角率领金角部队全员精英乘胜追击，众人商量需要让其中一个人担当诱饵来引诱敌军，以保证其他队友能够有时间顺利逃脱。扉间为选择正确的继承人而暗中考验着部下。
团藏虽然抱持着想要自告奋勇担当诱饵的心念，但在关键时刻却因胆怯而没有说出。此时日斩挺身而出，提出让自己担当诱饵。最终扉间为了木叶隐村的未来而决定亲自担当诱饵，临行前对日斩的行为表示赞许，并授命日斩成为下一代的火影，之后便因掩护日斩等人而牺牲。
在日斩继位火影后，日斩任命团藏为火影辅佐，给了团藏极大的信任和权力，但由于日斩没能延续第二代火影治理宇智波一族的基本方针，因此使团藏背负起了村子的黑暗，于是，团藏以“暗部培训部”的名义，培育了自己的势力“根”，根组织比暗部隐藏得更深，所做的事也更加见不得光。三代默许了这些。团藏和根成为了木叶最直接有效的利剑，以“宁错杀，不放过”的姿态铲除村内外一切威胁，日斩曾让自己最喜欢的徒弟大蛇丸担任团藏的亲随，足见日斩对团藏的器重。
日斩是阳光下永远温暖的火影，团藏是黑暗中杀伐果决的根。两人相辅相成，让木叶村再度成为了最强忍村。
木叶村一直有一个隐患，那就是封印在村内的九尾，初代火影死后，木遁这种封印尾兽的手段失传了，于是日斩和团藏举全村之力展开对柱间细胞的研究，想要让木叶重新拥有木遁，但随着大批志愿者在实验中牺牲，三代不得不喊停，所有相关记录都作为黑历史被封存，但团藏却没有放弃，他不在乎要牺牲多大，不达目的不罢休，他伙同大蛇丸偷偷从周边村落绑架婴儿，私自进行试验，六十多名婴儿几乎全部死去，但在残忍的代价下，真的有一例成功了，团藏培养出了除柱间外另一个能够使用木遁的忍者大和，因出于私心他并没有把大和的存在告诉日斩，但后来日斩发现这名木遁忍者的时候，并没有治团藏的罪，只是率领暗部将团藏的根据地里三层外三层的围起来，将那名木遁忍者要到了自己麾下，日斩对团藏非常宽容，只要他的罪行不闹地沸沸扬扬全村皆知。他都是睁一只眼闭一只眼。
曾将有才能的孤儿药师兜用为间谍派往各国，之后又认为兜知道太多秘密，而策划他与孤儿院的院长野乃宇自相残杀。
他亦曾与其他野心家有所联系，如曾与雨忍首领山椒鱼半藏合作，怂恿半藏铲除以弥彦为首正在崛起的新势力，导致弥彦的死亡及长门（即后来的佩恩）性格理念上的扭曲。
曾与大蛇丸有所接触，故为掩饰此事正加派人手追捕大蛇丸的助手药师兜。团藏以“一切都是为了木叶忍者村”的信念为由，在暗中进行着各种无法摆上台面的行动，以这种姿态支持着木叶的发展；而为了进一步贯彻自己的理念，身为鹰派代表人物的他一直有争夺火影之位的想法。
在遴选第四代火影之时曾打算支持大蛇丸上位以加强自己手中的权力，但在日斩强烈的意愿下最终成为第四代火影的是自来也的徒弟波风水门，团藏的想法也因此没能实现。水门死后，再度企图争夺火影的团藏也在高层顾问们的质问下未能如愿，而由日斩重新担任火影之职。
宇智波一族计划发动政变被木叶高层注意，因此，团藏趁机策划了一举铲除宇智波一族以绝后患的计划。因为他无法信任宇智波一族，所以夺取了本想阻止宇智波一族谋反的止水的右眼，并以“可以保全佐助的性命”为理由叫双重间谍身份的宇智波鼬做出选择。鼬一方面为了村子的未来，一方面为了保护弟弟佐助，而接受了灭族任务，并在之后成为叛忍，团藏的计划得以继续实行。
当纲手继任为第五代火影时，团藏对她继续贯彻日斩的政策而有所不满，并在新卡卡西班成立时安排自己的部下佐井进入新卡卡西班。
给佐井下达了暗杀佐助的任务，但后来由于种种原因而导致暗杀佐助的任务失败。团藏得知此事后，说出“感情带来仇恨，仇恨导致战争”的话语。
在“晓”的首领佩恩为了捕获九尾而袭击木叶时，团藏为了趁机夺取火影之位，而杀了正要前往妙木山通知战事的联络蛙孝介，试图隐瞒战事来牵制住鸣人的行动范围；并召集过去的“根”成员，下令让木叶陷于佩恩入侵的苦战中而不伸出援手。纲手在佩恩入侵一战后因虚耗过度陷入昏迷中，团藏便趁机在火之国会议中直指纲手已不能履行职责，应委任新一任火影，并道出过往火影治理上的不当，唯有自己才是最理想的人选，最终被大名指定为“第六代火影”。
团藏在成为火影后立刻将宇智波佐助定为叛忍并下达追杀令，亦允许雷之国忍者前往追杀。
在五影会谈上，他利用先前夺取的止水的写轮眼控制了铁之国大将三船，企图夺取忍者联军控制权，但被拥有白眼的雾忍青所识破。于是团藏向其他四影说出自己有意效仿初代火影统一各个族落那样来统一整个忍者世界，并且会不惜一切代价来完成这个目的，这样忍者世界才能步入真正“和平”的道路，但他的想法遭到其他四影的反对。
此时，佐助也因为宇智波带土的讲述而知道关于鼬的真相，打算杀死木叶高层来告慰亡兄，并乱入五影会谈的会场企图刺杀团藏。佐助的行动遭到其他各影以及铁之国武士的阻止，团藏在混乱之中逃脱。这一举动被雷影认为让木叶失去其他四大忍村的全部信任。
佐助在会场中被宇智波带土所救，之后和带土一同追上逃离会场的团藏。团藏利用先前获得的宇智波族人写轮眼施展了禁术“伊邪那岐”，让佐助发动的攻击变得无效。但在最后佐助利用写轮眼的幻术破解了团藏的伊邪那岐，团藏因此身受重伤，为了保存实力而挟持了在场的香打算逃跑，但一心复仇的佐助完全不顾香的安危，将团藏和香一同贯穿。团藏在临死前为了死守止水之眼，发动了里四象封印术打算与佐助、带土同归于尽，但最终失败。团藏在临死前感叹到自己到最后都没能成为火影，自己无论如何都无法追上日斩。并评价日斩和自己道“你是沐浴阳光的木叶，我是深埋地下的根。”
志村团藏，年轻时担任过第二代火影的精锐护卫部队中的成员，是和猿飞日斩争夺过火影之位的男人。在争夺继承者失败后，他成为了火影直属队伍“暗部”中“根”的创建者与领导人。有着只顺从自己意志的忍者队伍，掌握着木叶的“黑暗”。他是下令对宇智波一族实施灭族政策的木叶高层之一。
团藏有着一头棕色的头发，留着整齐的平鬓，一只细长的眼睛，目光狡黠而深邃。头部和右眼用绷带裹着，将止水的写轮眼隐藏其中。下巴位置有一个叉形的疤痕。他的脸色略显阴沉，皱纹深刻，给人一种阴险而老谋深算的感觉。他的身材虽然瘦削，但肌肉结实。身穿黑灰色和服，右手臂上移植了柱间细胞和十一只写轮眼，并用封印器皿将写轮眼牢牢封印，只有使用时才会解开，平时一直隐藏在衣袖里。
不过这个时期的团藏还没有经历那些。
极度多疑、谨慎、阴险、手段强硬，不相信他人，不能容忍一丁点可能会出现的疏漏，一定按照自己的想法走才肯放心。他常把“忍者要自我牺牲”挂在嘴边，但真正轮到他的时候，自己却做不到。
这也是他当初落后猿飞日斩，没有成为火影的原因。
原剧情中，在五影会谈推选忍者联军统领时，即使三船本就有意推荐他，但他仍要以别天神控制三船，支配其行动。为了防止泄密，对所有部下施加了咒印术。
团藏的木遁秘术源于移植初代火影柱间的细胞。因为十一只“写轮眼”具有很大的精神能量，所以需要柱间的细胞来增加“肉体能量”与之平衡，但由于不是初代的完整复制品，其木遁之术只能通过右臂才能施展出来。在战斗中，团藏自身查克拉减弱无法支配柱间的细胞时，会被其吞噬。
写轮眼是宇智波一族特有的血继限界，具有观察眼、复制眼、催眠眼等强大的能力。拥有者具有超乎常人的洞察力，能观察查克拉流动，可以施加和识破幻术，复制体术和非血继限界忍术。团藏在消灭宇智波一族的行动中，收集了宇智波一族的写轮眼和抢夺了止水的右眼，并且都移植到了自己身上，使自己拥有了宇智波一族的瞳术。
当然现在的团藏也还不具备这些，否则的话上一次长门就无法从团藏手中逃脱。
“先将那双眼睛给我。”
在团藏的示意下，身后的两名根部忍者来到了长门的身前，从已经失去双眼的长门手中拿过了两颗淡紫色的轮回眼，随后转身交到了团藏的手上。
在这个过程中，长门并没有做出任何反抗，在他决定好贡献出自己的双眼那一刻，就将自己的生死置之度外了。只要能够保证父母安然无恙，就没有什么是他不能牺牲的。
在从自己的手下那里接过了两颗轮回眼之后，团藏拿出了事先准备好的两只玻璃试管，将两颗轮回眼分别装了进去。这是团藏为了此次行动，早就准备好的。
“终于，终于得到了这双仙人之眼，它们是我的了。”
团藏小心翼翼的将装有轮回眼的玻璃容器给收好，那可是他成为火影的希望。
“现在可以将我的父母都放了吧？”
半跪在地上的长门由小晴搀扶着，失去了眼球的眼眶紧闭着，仅凭感觉朝着团藏所在的方向询问道。
第215章 永恒的神威万花筒（一）
此时此刻，长门和他的父母，还有小晴的命运，都在志村团藏的一念之间。
团藏他真的会信守承诺，放过他们四人吗？
“杀了他们，不要留下活口。”
答案是否定的，在得到轮回眼之后，团藏的第一反应就是让知道这件事情的人永远消失，以防泄密。
根组织的忍者都被团藏的秘术所控制，团藏并不担心他们泄密，但是长门这四人就没有继续留下活口的必要了。
“你答应我的，会放了我的父母！”
气愤的长门想要起身反抗，却因为身体虚弱且失去了眼睛，刚刚站立了一半，身体便忽然一软，倒了下去。
“真是天真的小鬼，现在我欺骗了你，你又能够奈我何呢？”
团藏上前两步，居高临下的看着地面上狼狈不堪的长门，心中充满了不屑一顾。
“你…….”
长门再次起身想要反抗，却根本提不上力气，再次跌倒下去。
“哼，你这样的废物，根本没有资格和我讨价还价。”
看着瘫软在地上无能为力的长门，团藏失去了兴趣。在将现场的事务交代完毕后，便先行离去了。
“杀了他们。”
一名领头的根组织忍者发号施令，现场的其余根组织忍者便准备动手。
“噗、噗！”
率先遭到杀戮的，就是长门的父母。
两名根组织忍者分别用苦无插进了两人的咽喉处，鲜血不断地从伤口处涌出，长门的父母伸出双手想要将喉部的伤口捂住，却发现根本做不到，只能徒劳地胡乱尝试着。
“啊啊啊啊！”
看见这一幕的小晴再次尖叫起来。
长门虽然因为失去了双眼，无法看到这一切。但是凭借着他敏锐的感知，很快便察觉到了这一切。
“父亲、母亲，不！”
就在长门痛苦的哀嚎声中，一名根组织忍者出手杀掉了小晴，一把苦无插在她的额头上，锋利的苦无瞬间便贯穿了小晴的大脑组织，却是没有给她造成任何的痛苦。
这下，就只剩下长门一个活口。
“失去了价值的废物，你应该荣幸自己能够为团藏大人做出贡献。”
那名刚刚解决了小晴的根组织忍者，转身来到长门的身前，面无表情地说道。
“那么，你就安心的去死吧。”
一柄同样普通的苦无插入到了长门的左胸口处，将长门的心脏贯穿，终结了长门的生命。
“为、为什么……究竟为、为什么？我明明那么努力了，为何还保护不了我的父亲、母亲……”
长门并不怕死，他害怕的是，即使重来一次，他仍旧无法保护好自己的父母免遭杀戮。
“我不甘心，我恨啊！”
在原剧情中，长门被鸣人的嘴遁所说服，心甘情愿地牺牲了自己赴死。
但是这一刻，长门是带着无比强烈的怨恨死去。
在彻底失去意识之前，长门的脑海中回放着过去的点点滴滴。
长门的早年经历十分坎坷，宇智波斑为了实行月之眼计划，将轮回眼移植到千手一族的远亲漩涡一族的后裔长门身上，希望日后长门能用外道轮回天生之术复活自己，而长门从此拥有了轮回眼。
宇智波斑死后，宇智波带土（面具男“阿飞”）按照宇智波斑的吩咐和绝找到三人，自称“斑”，试图拉拢长门，但被弥彦阻止。弥彦死后，长门再次遭受失去重要之人的巨大打击，他意识到之前找到的答案根本就一文不值。认定只要在这个被诅咒的世界，不会有真正的和平，人与人之间是永远不会相互理解的，对和平的理解走上了极端。于是长门和宇智波带土合作，计划收集尾兽，开发新的禁术，制造尾兽兵器，获得可以瞬间摧毁一个国家的力量，靠人类对那些痛楚的恐惧来抑制战争，以痛苦的方式引导世界，让世界走向和平。晓也因此改变了性质，从原来的雇佣兵组织变成了一个由S级叛忍组成的邪恶组织。
自来也为打探晓首领的情报，潜入了雨隐之村。之后见到了佩恩及小南，这才知道原来晓首领佩恩是自己在第二次忍界大战末期在雨隐之村所收的徒弟长门。冷酷无情的佩恩已不再顾念师徒之情，师徒之战一触即发。自来也使出仙人模式，并召来两位蛤蟆仙人（深作及志间仙人）相助，成功打败了三个佩恩。但因之后不了解佩恩六道的能力，所以最终被佩恩六道打败而牺牲。但最后自来也查出了佩恩六道及其本体的秘密（都是自己曾经遇到的忍者，佩恩六道均为傀儡忍者，受长门操控）。
佩恩和小南一起袭击木叶捕捉九尾人柱力漩涡鸣人。修罗道、畜生道、饿鬼道分为诱敌组；天道、人间道、地狱道和小南为探索组，开始了袭击。期间与卡卡西交战，并杀死了卡卡西，在用人间道得知了鸣人在妙木山后，控制天道来到木叶上空，然后用畜生道将修罗道、人间道、饿鬼道、地狱道还有小南通灵到木叶村外，不惜以缩短寿命的代价，执意使用神罗天征将整个木叶隐村摧毁！之后佩恩六道与从妙木山赶回来的漩涡鸣人交战。
佩恩六道被漩涡鸣人逐个击败后，鸣人在小南用纸制作的一棵大树里找到了佩恩的本体长门，两位预言之子终于相遇。鸣人想要知道长门的过去，并想从长门的经历找出和平的答案。长门将父母之死及挚友弥彦之死一生两大痛楚向鸣人讲述后，鸣人拿出了自来也写的第一本书《毅力忍传》。《毅力忍传》的写作灵感来源于自来也的一个弟子，这个弟子正是长门。经过一番谈话后，长门被鸣人所感化，重拾少年时期的梦想，放弃和宇智波带土的原定计划，用外道轮回天生之术复活了在佩恩一战所死之人，将自己的意志托付给了鸣人后力竭而亡。
第四次忍界大战时期，长门被药师兜用秽土转生复活，并与宇智波鼬一起行动。后被兜控制与鸣人和奇拉比战斗。失去意识的长门，缺乏自主机动性。在吸收奇拉比的八尾查克拉后身体恢复了原来年轻的状态，但由于腿上的伤，依然无法自如行动，兜便以通灵兽的轮回共享视野弥补这一缺点，相继捕获鸣人与奇拉比，两人危在旦夕。但最终却因中了别天神而脱离兜控制、隐蔽起来的宇智波鼬从死角射出苦无破坏共享视觉共享而失手。之后长门使出地爆天星，鼬分析出地爆天星的特征以及弱点并引导鸣人与奇拉比一起合力使用最强远程攻击忍术破解了地爆天星，随即长门被宇智波鼬的十拳剑所封印。
在临死之际，长门恢复了意识，对自己的一生做了评价，充分认同师父自来也的第一部作品，给予了堪称完美的评价；对自己的第二部作品给予了一般评价；并把希望寄托于鸣人，希望鸣人的第三部完结篇，能够完美落幕，抹掉自己的第二部的缺憾。最后，长门带着希望，含笑而逝。
画面回到现实当中。
幻境中长门经历了小半年的时光，在幻境之外的现实世界中，时间只过去了几分钟。
中了万花筒写轮眼幻术的长门，此刻正两眼无神地站立在原地。而施展幻术的宇智波止水，已经来到了长门的面前，左眼中的万花筒花纹快速旋转着。
“瞳术八岐。”
将长门控制住后，止水决定开始掠夺长门的血脉。
可能是因为长门的实力更加强大的缘故，在止水发动了瞳术之后，长门那融合了外道魔像残躯的身体上只出现了些细微的损伤，一些微小的颗粒开始从长门身上被分解出来，接着被止水所吸收。
这一过程虽然速度缓慢，但也只是多消耗一些止水的万花筒瞳力罢了。对于拥有着永恒万花筒写轮眼的止水来说，只要将瞳力的消耗控制在可以同步恢复、补充的范围内，他就可以一直将八岐这一瞳术维持、延续下去。
如果一直这样下去的话，将长门的血脉彻底地掠夺掉，也只是时间问题。
可就在这一过程进行了一会后，本来被控制住的长门忽然出现了情绪波动，那是抵抗的情绪。
接着那种情绪越来越强烈，给正在施术的止水造成了额外的负担。为了在控制住长门的同时对其进行血脉掠夺，止水的万花筒瞳力被急剧的消耗着。
“难道是他正在摆脱我的幻术控制？这怎么可能？”止水此刻也是惊疑不定。
并不是止水骄傲，而是几乎没有人可以在被万花筒写轮眼幻术完全控制下，再次靠自身的力量来摆脱这种控制，至少在忍界的历史上就从来没有出现过，此刻却货真价实的在长门的身上发生着。
止水感觉到，事情正在朝着自己不可控的方向发展着。
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